踩刹时间长时发动机怠速运转的动力会损坏变速器齿轮吗

应该是允许的，怠速的扭矩很低的，你踩很容易熄火的，这点扭矩都承受不了，那么这个变速箱可以直接丢到垃圾堆里。

不会，有离合器保护着~~

你说的是自动档变速箱吧。手动档在空档状态下发动机跟变速箱之间动力是切断的。自动档如果在D档长时间踩住刹车而发动机在工作状态下，变速箱内部油温会升高，容易烧坏变扭器。放P档或N档拉好手刹好了，长时间踩刹车增加刹车总泵分泵密封件负荷造成疲劳老化不说，还增加了腿部肌肉疲劳酸胀不是。