等位基因的序列长度一样吗

不一定。

应该是一样的吧，等位基因本来就是姐妹染色单体上的，而姐妹染色单体是非形态、大小都相同，所以等位基因也应该是相同的。

应该是一样的，常染色体一样，性染色体不一定了，因为分X和Y染色体的~这样就不一一对应了。