报关单被货代公司押单造成了出口退税时间过期，无法申报退税。会计要不要负这个责

说的不明白，你的算法应该是错的。
逾期未申报退税视同内销，需征增值税，原进货增值税发票可以抵扣。
1 销项税：
按照出口报关单上美元离岸价,换算成FOB价，然后按照汇率换算成人民币，应该就是你说的 “204385.98”，销项：204385.98*0.17=34745.62
2 进项税：
你的进货发票上的进项税额。
3 需要缴纳的增值税
= 销项-进项-上期留抵税额 若的>0需要交税；<=0不交税
（如果增值税进货发票已经做账，需要调账，将“出口退税13%”和“已经计入成本的征退税差额4%”转到进项税。）
公司的损失应该就是13的退税加上需要缴纳的增值税。
另外，货代公司的做法应该是违法的，你们可以咨询律师索赔。