海关系统有问题，出口退税联收不回,影响了单证收齐，有什么办法可以解决啊？

看是否超过出口的90天，如果即将超过，提前给国税局打报告；

因为电子口岸的出口信息，国税也是可以看到，仅是海关系统原因拉不出单子，国税不会处罚的。

出口退税联不是收不回，而是税务那边没信息吧！单子是不可能打不出来的。
这种事很麻烦的 ，这样你要出情况说明一次次跑。我当年跑了两个月，就是没信息。最后海关出具书面证明给税务才算结束。