我的逆转裁判为何时间一久就在模拟器里找不找了呢

……那个，我不太明白你问题的意思……先按我理解的说吧~

是GBA模拟器的话——如果是在“新近ROM”项里消失的话是因为那个列表是按时间顺序更新的，只要在逆转在列表上的时候按一下“固定”就能固定列表项目了。
NDS模拟器的话——找不到只可能是你把ROM挪地儿或者删除了。还有不要给ROM重命名。因为它的存档和GBA不同，并不分出来，而是跟着*.nds一起走的。重命名后就好像格式化一样，存档空白。（用模拟器第一个选项刻意单存出来的不算。）