专科已经考过的科目，然后考本科的时候是否可以申请免考呢？

一般是不行的，如果是网络教育，有个别高校有这个优惠条件，比如东北财经大学网络教育对于东北财经大学网络教育专科毕业生继续读东财网络教育本科的学员，在专科修过的课程如果总评是85分以上，本科阶段可以免修，但其他高校就没有这个优惠，至于自考、成高、电大等肯定没有这种优惠条件！

如果的确是同一科目并使用同一教材的话是可以申请免考的~
申请免试时，需向自学考试管理部门提供附有免考科成绩的专科毕业登记表原件及其它相关证件、证明

不过，专、本科，即使考试科目名称相同，未必是同一层次同一教材~
比如公共科目里的英语，专科考的是英语（一），本科则是英语（二）

不可以。你可以向学校申请免听，但考试还是要考的。