房产证上只写一个人名字到底会惹多大麻烦？

不可以
因为这是你们 婚后的共同财产.
共同还贷的! 不用担心!

这点法律常识你都没有啊?

她如果转卖房产，办理手续的机关会要她出示未婚证明，如果是已婚的就会要求她的配偶给她授权，如果是离婚的，会要她单身证明，但是在租赁和抵押的时候手续没有这么严格，凭她一个人的签字就可以了，——当然，如果严格地讲这是不合法的，但是如果已经做了要废止就会比较麻烦。
按照你的情况她是可以取得单身证明的，因此她可以卖掉房产。
最好是让你的律师给她一份正式的律师函，告诉她在没有完成财产分割之前，她不得擅自转让房产。
不过如果她执意转让，她可能只需要出示她和转让价值有关的证据，将转让所得的一半分给你，在这种情况下， 她可能会隐瞒真是的转让价。你就不得不依据评估单位的评估价和她交涉，……非常麻烦。