我上的自考，现在准备考公务员，而且有毕业证，可学校说把我档案丢了，我该怎么补办

学校原因的话，他们有义务为你办理，必要时可以寻求法律、媒体等。
自然，前提是必须他们的过错，涉及到这些事情，每个环节都有人签字的！

你自考老大怎么不想，你的学习档案是独立存在啊
你先找主考院校，问清楚你的档案编号，用力毕业证上的编号去学习档案室找找，实在没有办法，去教育考试院看他们有没有原始资料，有就好办，因为自考试的档案除非你工作了一般不调到人事局。