一般纳税人收到增值税发票，但三个月没有确认怎么办？

不能认证，属于滞留票，全额进费用。

超过90天没有认证，已经过期，不能再认证抵扣进项税，全额进入成本。

不知道楼主是哪里的？
我是广西的，广西这里的国税局规定，如果超过90天没有认证，在下一个抄税期你还是可以认证的，这是你最后的一个机会了。
如果不认证，那这个税只有进成本了，不能抵扣。

曾遇到过公司会计延误了将海关开具的增票认证的问题，如上面几位所讲，过90天只好全额进成本。

但后来一想，如果开票方是公司的话，假设由于快递遗失，收票方在季度清查时才发现，是否可以依据丢失类特殊情况，由开票公司配合到对方税务局办理类同遗失处理。

不知此操作有没人操作过。因为这也是真的可能存在的一种情况。不过税务局肯定要出具相关公安证明材料的。只是这样的非主客丢失，是不是可以允许超90天。