系统的分区和格式化有什么关系

从你的描述来看，可能的机器里的硬盘存在问题或者有可能你机器中的病毒比较特殊。

你既然提到了重做系统
那么建议你如下操作：
1.用安装版的系统光盘启动机器，进入安装程序后将硬盘上所有分区都删除然后全部格式化一次；
安装的系统最好选择Windows XP sp2版以上，安装时最好将磁盘格式为NTFS格式，因为它在安全性的设置上是比较全面的。
2.系统安装好后，装好各种驱动（驱动的安装顺序最好按照下面的顺序：主板驱动－较新版本的DirectX－最新的显卡驱动－最新的声卡驱动－网卡驱动－其它设备的驱动－各种应用程序）并设置好；
3.用网上的一些教程（可以用别的电脑上网来查看这些设定）来关闭系统的一些不安全因素。比如默认的共享、ftp上传后门、服务中的远程注册表服务等等。
4.安装360安全卫士，对一些常见的流氓软件进行免疫。
5.安装杀软和防火墙；
6.上网。在第一时间里升级杀软和防火墙的病毒。
7.结束后。挂到Windows Update上去打齐补丁（如果不是正版的系统就不建议用这个方法来打补丁了，呵呵，要黑屏的）或者用360安全卫士的“修复系统漏洞”功能来打齐补丁。完了下网。
8.Ghost。并最好将镜像文件刻录到光盘上保存。
9.在资源管理器里点击：工具－文件夹选项，在“查看－高级设置”项目下取消“使用简单文件共享（推荐）”前的勾。然后在系统盘下右击“Program Files”、“Windows”及其“Windows/system32”文件夹，选择“属性－安全”，在“组或用户名称”下为用户设置如下权限：
Administrator和SYSTEM组：“读取和运行”、“列出文件夹目录”、“读取”；其它的所有用户，取消一切权限。
用同样的方法对注册表中的HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Image File Execution Options键值进行同样的操作。
10.安装一个监控类的软件，SSM或WinPatrol。安装一个木马查杀类软件，如“杀