全额事业单位扣工资有没有法律依据

《劳动法》的实施，不仅是各类企业，国家机关、事业单位涉及用工的也在其调整范围。用人单位依据劳动法律法规建立规章制度，只要这些规章制度经过一定的民主程序，并以公示生效，且未与现行的法律法规相抵触，就是合法的，法律是认可的。按以上原则建立的规章制度，依据规章制度实施奖惩，并无不妥。

我国《劳动法》和《劳动合同法》的覆盖范围包括企业和事业单位，根据这两个法律的精神，用人单位可以制定自己的规章制度，这些制度只要通过民主程序设立（一般要求工会或职工代表参与讨论），并且已经公示给全体员工，且不与现行法律法规相抵触，法律上就认可这些规章制度，当然也包括其中的奖惩办法。

像你说的情况很普遍，现在普遍认为单位的做法是合法的。

单位胡折腾。