求设计SSR引物的步骤，越详细越好

来源：百度知道编辑：UC知道时间：2024/05/29 07:32:08

设计SSR引物，我想在水稻的日本晴和籼稻某段序列之间设计SSR引物，以找亲本间多态性。
希望高人指点迷津。

水稻的基因组应该测序了，你在基因库中搜索简单重复序列，如（ac）5个重复，搜索的结果会显示水稻基因组中那些地方含有这些重复，然后将序列调出来，看看（ac）5个重复的左右序列是什么，然后可以直接使用或者根据左右两端的序列用引物设计软件设计引物。

现成的SSR引物都有了，直接拿去用就好，何必自己设计