谁知道黑执事中夏尔的秘密是什么？

夏尔是以灵魂为代价与塞巴斯签立了保护他和达成夏尔一切愿望的契约。

夏尔在父母被杀之后，被一些上流社会的贵族抓起来，进行黑魔法仪式。应该是在进行仪式的时候，夏尔为了获救才和恶魔(塞巴斯)签订了契约吧。动画一开始有放的，那只乌鸦应该就是塞巴斯的原型。

契约内容是而在夏尔死后，塞巴斯可依据契约取走灵魂，夏尔可凭借契约召唤塞巴斯，契约也使夏尔的灵魂无法逃脱塞巴斯掌控。

这个所谓的“不洁”就是指被黑魔法已经污染的少爷的身体。

他家被仇人点起大火烧掉了，爸爸妈妈都被烧死了，他被人抓去进行黑魔法仪式，后背上还有那个时候受伤的烙印。塞巴斯对夏尔舍弃灵魂的觉悟和坚定所吸引，要和夏尔定下契约，条件是夏尔出卖灵魂给他，（塞巴斯是被夏尔从那枚戒指里放出来的），所以，塞巴斯就会一直保护他，不会让他死，又把他带回了家里。
大概就是这样...
另外...楼上的说的很对，很全面...
楼主应该考虑采纳这样的答案...

契约」（Indenture）
我愿与凡多姆海恩家族缔结契约，誓死保卫家族之名，捍卫家族的荣耀，效忠于凡多姆海恩家族。如有背叛，愿以灵魂世代不能得以解脱作为代价，洗清我的罪恶。
我愿与恶魔执事赛巴斯钦缔结契约，献上灵魂以祭祀，成为恶魔，奉命于执事，换取享乐。如有背叛，愿以灵魂世代不能得以解脱作为代价，洗清我的罪恶。
我愿与少爷谢尔·凡多姆海伍缔结契约，献出我的所有，付出我的一切，只为换取少爷真正开心的笑容。如有背叛，愿以灵魂世代不能得以解脱作为代价，洗清我的罪恶。

《黑执事》（另译：黑管家）。执事塞巴斯钦·米卡利斯（又译：雪巴斯查恩/塞巴斯钦，简称雪巴斯/塞巴斯）负责照顾12岁(在最新连载中已过13岁生日）的伯爵谢尔·凡多姆海伍少爷。管家塞巴斯钦是恶魔，他和夏尔少爷订下了契约，在夏尔达成自己的目的前永远忠于主人。夏尔订下契约代价是自己的灵魂。这是一个执事与主人的故事，其中也不乏惊爆的笑料，情感的抒泄。