噬魂师：maka和soul在漫画中后来在干什么呀？

这个问题真的很难回答，我根本不清楚你到底再说后来干什么，这个后来的分界点到底在那里，那么我暂且把这个后来放在鬼神逃脱死武专作为分界点吧。
大体情况是这样的，由于受到鬼神的狂暴之气的影响索达恩在和杜梅沙的对决中凭借着狂暴之气侥幸胜利，同时美杜莎也是凭借着狂暴之气力量逃脱了死武专，但是也应为消耗大量魔力而变成了小孩子的模样，后来蜘蛛恐惧出现了，死武专与蜘蛛恐惧进行了一定的拉锯战，争取各种密器，为了防止蜘蛛恐惧的BOSS奥拉克尔回复以前的魔力，同时作为奥拉克尔妹妹的美杜莎对她这个姐姐有很大的厌恶感（当然不单单是仅限于厌恶，还有更深层的利益，毕竟奥拉克尔被死神封印就是因为美杜莎的把消息泄露出去了，这些秘密作者会后来为我们揭晓的，姐妹两人根本就是水火不容）美杜莎出了狠招，只身来到死武专想要与死武专合作，一同消灭蜘蛛恐惧，由于死武专背腹受敌，既要应付鬼神，又要应付蜘蛛恐惧，不得不接受与美杜莎的提议，一同合作暗杀奥拉克尔，崩溃蜘蛛恐惧，美杜莎则挑选了部分死武专人员一同与她执行任务，里面就包括玛嘉与SOUL，当然死武专也相应提出条件要带一个检查员也就是KID，然后他们就按美杜莎提供的密道进入蜘蛛恐惧内部， -----------具体过程省略，达到奥拉克尔的密室的时候，玛嘉一行人却发现了奥拉克尔早已死去，然而在密室中还存在着一个人，正向她们靠近………………然后%%￥##￥@@￥%@@然后连载就到这里了，等待下期连载吧。

哇
有漫画呀

当然有漫画……
死武传攻打蜘蛛恐惧之前maka和soul是和kid去打道化师的，这一段貌似骨头社为了赶结局所以动画里就没有了（没有了！！泣！！那么美丽竟然！！没有了！！）在这一段中maka修炼（？）出了魔女狩猎的power up版本魔人狩猎，而动画中直接把这部分放进波乱战里了。

拒绝剧透。