重装系统能把在d盘内的加密的文件夹格式化吗

应该是可以的。因为重装系统要把磁盘上的所有文件删除，系统重装完成后，你在格式化D盘，打开后就没有了。不过重装系统会是你目前的所有文件都会被覆盖的，不过你必须在重装系统的过程中就用系统安装盘把D盘格式化。

系统在c盘的话 不会对d盘的东西做任何修改
不过.很有可能换了系统之后 d的原先加密的东西就再也打不开了..

360文件粉碎机。
一般文件都是可以搞定的。

还有看看你是用什么加密软件？

一般都是可以删除的（要有密码）。