09执业医师考试大纲和08年的大纲有很多不同吗？

是的。本次执业医师考试大纲变化，是自执业医师制度实行以来，最大的一次变动。操作实践、综合笔试都有变动。各考试科目内容也都进行了调整。详情：
http://www.mede66.cn/asp/wangxiao/yishi/

执业医师3月份就开始报名，最新版的教材也在3月份能出来。你可以看08版的书，但要留意大纲的变化。