运行CMD闪了一下就关闭

这可能是被管理员设置了禁用命令提示符窗口导致的这种现象，可以尝试以下两种方法。

（1）利用组策略

开始-运行-输入gpedit.msc，打开组策略。用户配置-管理模板-系统，在右边窗口双击“禁止访问命令提示符”，选择为“未配置”。

（2）利用注册表

“开始\运行”命令，然后在打开的“运行”对话框中输入“regedit”，打开“注册表编辑器”窗口，并定位到HKEY_CURRECT_USER\Software\Policies\Microsoft\Windows\system，接着在右侧窗口找到DisableCMD并双击将其值修改为0或者直接删除该键值即可，关闭“注册表编辑器”窗口，回到系统中就可以打开命令提示符窗口了.

在“运行”中运行cmd命令，当命令不存在或错误时会出现一闪而过的现象

若指的是用cmd调出命令提示符，出现这情况，那该是命令提示符调用出错，可进行系统文件修复：
开始-运行输入cmd，回车

再键入sfc /scan now（注意sfc后的空格），回车

按提示插入系统安装盘

接下来没你的事了，只要关闭安装系统的窗口就行—别当这是重装系统，告诉你这是系统文件修复

这能解决所有关于系统文件被改和错误现象

还有一种可能的现象是映像劫持，将指定的程序指向一个不存在的程序名，这样当从命令提示调用时，出现的就是一闪而过的命令提示符
简单的方法是，用“AV终结者专杀工具”或“超级巡警”进行安检与修复
若，问题严重了，下地址可能帮助你：
http://zhidao.baidu.com/question/45456305.html

是不是安装了什么比较敏感的杀毒软件呀！病毒防火墙设置了吗？

.bat是批处理文件