全国专业技术人员计算机应用能力与全国职称计算机考试是一样的吗?

一样。
下面这是2009年职称考试最新安排。
http://www.bjpta.gov.cn/ksjs_z_z1.asp?exam_id=9这是人事网链接。

北京地区全国专业技术人员计算机应用能力考试(最新考试安排)

北京市人事考试中心
京人考函[2008]40号
关于2009年度北京地区全国专业技术人员计算机应用能力考试计划有关安排的通知

各有关单位：
根据北京市人事局《关于北京市专业技术人员计算机应用水平考试有关规定的通知》（京人发〔2000〕111号）、《关于全国专业技术人员计算机应用能力考试有关问题的通知》（京人发〔2002〕9号）、《关于简化职称评聘程序调整有关政策的通知》（京人发〔2003〕37号）和《关于北京市专业技术人员计算机应用水平考试有关问题的通知》（京人发〔2006〕98号）文件精神，结合北京地区实际情况，现将2009年度北京地区全国专业技术人员计算机应用能力考试有关安排通知如下：
一、考试科目设置及选择
（一）考试科目设置
全国专业技术人员计算机应用能力考试采取科目模块化设计，每一科目（模块）单独考试。考试采用上机操作的方式，所有科目的题库均运行于Windows XP平台。
2009年度本市将取消中文Windows98操作系统（101）、Word97中文字处理（201）、Excel97中文电子表格（202）、PowerPoint97中文演示文稿（203）、 WPS Office办公组合中文字处理（204）、计算机网络应用基础（301）、AutoCAD（R14）作图软件（501）七个考试模块。
2009年度考试科目（模块）设置为18个（详见附件）。
（二）考试科目选择
1、北京市所属单位（含委托本市代评的中央所属单位及相关单位）的专业技术人员均按有关规定参加相应科目（模块）的考试。
2、国务院各部委、各直属