在美国是不是有研究外星人的基地

应该是有的，据说与CIA有关，例如：曼哈顿计划（与美国空军联手）。
基地有：木洛克（现在的爱德华兹）空军着陆基地。
参考事件：罗斯维尔飞碟坠落事件
内华得州阿斯特克的不明飞行物残骸，有17个外星人尸体，在重要的白沙导弹实验场的附近

51号基地

其实根本没有，著名的51区实际上是美国空军和著名厂商开发实验尖端科技的重要场所．因为其非常保密，也因为其中出来的武器和技术非常超前，远超当代水准，所以被很多人误解为外星人科技。

应该有吧