【the doctor asked charlie to breathe deeply. ___】

A charlie did so 查利照着做了.

B so did charlie 因此查利做了（深呼吸了）。

so charlie did不是更好？

我个人认为这道题（如果在楼主没抄错题的前提下）选A更说得通。

一楼的说反了。
而且so sb do MEANS某人确实怎样。
so do sb MEANS某人也怎样。

so + 助动词+ sb. 表示 某人也怎样
sb. +助动词+so 表示 某人的却怎样