报考南京农业大学的自考可以在扬州考试吗？

可以

南京农业大学得

扬州大学没有自考的考点，如果扬州有考点，如果扬州的考点开考南农的企业管理，那么就可以在扬州报名和考试，如果没有，就不行了，得去南京或有考点的地方考。
你报考的是南京农业大学，最后盖的是南京农业大学和江苏省自学考试委员会的章，毕业证书上盖有这两个章。