知识产权入股后专利权是否归公司所有，如果公司被并购，专利权是否归并购公司

不一定.这取决于你和公司的合同是怎样签的.
知识产权,有所有权和使用权以及部分使用权.
如果你把专利作为无形资产进行评估后,按评估价值折价入股,那么知识产权就无条件地属于公司所有.因为是对于你的知识产权的所有权进行整体作价,你已经取得合理的对价,可以理解为你把知识产权卖给了公司.公司用股份作为代价,取得了你的产权,并且对专利权人进行了变更.你已经不再对此知识产权拥有权利.公司被并购时,也可以评估作价归入并购公司,并取得相应的对价.
但是你如果只是把技术使用权与公司进行合作,你取得相应的股份或者取得报酬,但是没有进行专利权人的变更,那么专利权还是你的,你用使用权和公司进行合作,公司只有使用权而没有所有权.被并购时,是不能用作资产来进行并购的.公司只能取消你的股份,新的公司也不再有专利使用权.

是的，知识产权必须办理专利权人变更，成为公司的无形资产。
公司被并购，可以评估这部分资产作价。再办理权属转移到新公司。