请问保护证人是谁的责任？

保护证人的责任，公安、检察院、公安都有责任。
主要是看你的案件是什么性质，或者处于什么阶段了
如果是民事案件，保护证人，主要是法院，
如果是刑事案件的话，如果在侦察队段，主要是公安，（当然，如果属于检察院自侦案件的话，主是检察院）
如果在审查起诉阶段，则主要责任应是检察院
如果是在审判阶段，应主要是法院。
当然，案件当事人也有责任要保护证人，而且证人有权要求因作证而必须的合理费用。