在药店工作的营业员可以考卫生系统的药剂师资格证书吗?

应该可以.
药剂师是中级职称,需要相关的资历证书,中级职称英语考试成绩.
所以问题不在你是营业员还是临床的,只要是相关的学历(学力),学位证书,当然相关的基础知识是不可缺的.

当然可以的,但你要挂靠一个医院的