苏州职工生育保险是在单位申报还是在社保局申报？

最好到社保局。男职工携本人身份证.就医证卡.（结婚证）或户口簿.配偶身份证及户籍所在街道出具的配偶无工作单位且无固定收入来源证明.计生部门出具的（生育保险联系单）.新生儿（出生医学证明）.出院小结.费用明细单.原始发票.到社保局办理一次性生育补贴申请手续。在社保局审核后，签字领取补贴金额.

1、对参加生育保险的男职工，配偶未列入职工生育保险范围，在符合计划生育规定生育时，凭结婚证(或户口簿)、《生育证》、男方《职工养老保险手册》及女方按政策无法享受生育保险的证明、就诊记录及医疗费用原始票据、明细清单等，向社会保险经办机构办理生育保险补偿待遇的申领手续。

2、可参考：《苏州市职工生育保险费缴纳、给付标准和手续》
http://www.szldbz.gov.cn/ywzn_content.asp?id=3050

苏州职工生育保险是在单位申报还是在社保局申报？

肯定需要由单位申报，而社保局是办理单位。
男职工需要本人填写入保申请书等即可。