关于购房协议的公证

不需要公证的。
购房协议只要双方协商一致，并签订房屋买卖合同后即发生法律效力。不需要办理公证也是有效的.
　　注意：
　　1、签订合同是双方自由、自愿的行为，只要双方的意思一致，签字了，合同就成立，就有效。公证和合同的效力是没有必然的联系的。
2、公证是公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。公证的作用是在发生民事争议之前，对法律行为和有法律意义的文书、事实的真实性和合法性给予认可，借以防止纠纷，减少诉讼。它不能为当事人解决争议。

我帮你理一下关系。
首先，这套房屋是部队分给一个军官，你从他那里买来，部队是不认你而认军官的。所以部队和军官才是直接买卖关系，你和这房子又多了层关系，是你和军官的买卖。你和军官签定的协议，没有得到部队的认可，法律上很难说啊。公正的作用也只是说明你和这军官双方有买卖约定，但是公正不能代表法律效应。你要想清楚，不过我想问题不大。