柯南510集以后的主线剧情

511 推理对决 新一VS冲矢昂
512 破碎的十二宫杯
513 杀意源自咖啡之香（前篇）
514 杀意源自咖啡之香（后篇）
515 怪盗基德的瞬间移动魔术（特别篇）
516 风林火山 迷宫的铠甲武士（特别篇）
517 风林火山 阴和电闪的终结
518 明治维新神秘之旅（探索篇）
519 明治维新神秘之旅（解读篇）
520 红酒的告发
521 杀人犯 工藤新一（特别篇）
522 新一的真实身份和兰的眼泪（特别篇）
523 真正想问的事
524 令人憎恨的蓝色火焰（前篇）
525 令人憎恨的蓝色火焰（后篇）
526 真凶送来的礼物
527 假面剧里隐藏的恶意
528 以柔克刚之谜（前篇）
529 以柔克刚之谜（后篇）

511推理对决！新一VS冲矢昴：剧情主线的关键人物，多方猜测冲是秀一
515怪盗基德的瞬间移动魔术：基德么总要看的，特别版嘛
521杀人犯！工藤新一
522新一的真实身份和小兰的眼泪
523、524 、525
新一系列，不过画得有点走样，让我崩溃5555

以上

阿笠博士的真面目

黑衣人的真正的首脑，就是一直隐藏在他们身边的阿笠博士DOC。LEE。
事情是这样的，工藤优作原先就怀疑并且侦察黑衣组织。以小说家的身份为掩护，秘密调查。发现一些线索后特意搬到黑衣组织首脑阿笠家的隔壁住，并且从小培养新一，并派新一和阿笠混熟想借此侦察一些情报。当阿笠开始怀疑工藤父子的时候，想出一条毒计，他派GIN和沃克跟踪出去约会的小兰和新一，大家都看过第一集，其实交易是幌子，真正的目的是跟踪，于是新一也就被他们变成了柯南。之后，阿笠顺理成章地成为了新一的同伴与监护人，并且柯南实际上成了阿笠手中的人质，当时新一的父母第一次出现的那一集，实际是和阿笠谈判的，最终的结果是阿笠以柯南要挟他们两个人流放到瑞士。而优作因为不能和新一说明真相，从而让新一感到受骗，受到伤害。只能同意阿笠的要求，不再回日本，所以你们看优作只有103集的时候