阿笠博士不可能是组织的BOSS

万事皆有可能

虽然我也认为不可能，不过你拿剧场版来说事实在是太没有说服力了……

剧场版是原创剧情，虽然没有脱离漫画，但那并不是原作者的东西。所以，不算数。

拜托,虽然是不可能,可是里面的什么情节没有呢!光凭这个就判断也太.....

这是什么问题= =，不一定吧

还有人说哀是坏的,哭~

汗！百科上的：碰巧的是宫野志保(灰原 哀)变小后倒在新一家门口也是被他发现的，一起想出了“灰原哀”这个名字，且让她寄住在家里。之后好心的博士收留了她(不过博士的计算机因此而倒了霉)。买了一台甲壳虫，常常载少年侦探团出去游。最近迷上了上网。因其名字与福尔摩斯探案中企图杀死福尔摩斯的教授相似，于是大家怀疑他就是——黑暗组织的真凶！ 黑衣人的真正的首脑，就是一直隐藏在他们身边的阿笠博士DOC。LEE。
事情是这样的，工藤优作原先就怀疑并且侦察黑衣组织。以小说家的身份为掩护，秘密调查。发现一些线索后特意搬到黑衣组织首脑阿笠家的隔壁住，并且从小培养新一，并派新一和阿笠混熟想借此侦察一些情报。当阿笠开始怀疑工藤父子的时候，想出一条毒计，他派GIN和沃克跟踪出去约会的小兰和新一，大家都看过第一集，其实交易是幌子，真正的目的是跟踪，于是新一也就被他们变成了柯南。之后，阿笠顺理成章地成为了新一的同伴与监护人，并且柯南实际上成了阿笠手中的人质，当时新一的父母第一次出现的那一集，实际是和阿笠谈判的，最终的结果是阿笠以柯南要挟他们两个人流放到瑞士。而优作因为不能和新一说明真相，从而让新一感到受骗，受到伤害。只能同意阿笠的要求，不再回日本，所以你们看优作只有103集的时候回过日本，还是变装的，不能让阿笠发现。
其实APTX-4689就是阿笠和灰原哀的父母联合开发的，而成功后哀的父母意外身亡。阿笠留着柯南不死只不过想观察药品还有没有其他的副作用。但是突然有一天，优作和有纪子突然潜回日本，和柯南（103-104集）秘密接触，让他感受到了威胁，于是安排一个间谍时刻跟随在柯南的身边，那就是灰原哀。哀其实是APTX-4689的第一个实验品，本来药的目的是永葆青春，没想到竟然适得其反产生副作用，造成了身体变小。而柯南事件发生后，哀就成了在柯南身边卧底的最好人选。为什么柯南从来没有被骚扰过就是因为柯南其实一