怎样在linux下部署windows下开发的项目

你的问题太复杂繁琐了，不是一句两句可以说清楚的，先多去看看linux基础吧，给你几个提升吧：
一，程序编码问题，最好都是UTF-8，否则容易出现乱码；尤其是中文；二,mysql在linux下和windows下是不一样的程序，但是基本命令都一样，你可以说使用mysqldump命令导出windows的表结构，然后导入到linux的mysql服务器；三，安装一个windows下连接linux的客户端工具，常用的有putty，xshell，SecureCRT等等，文件传输有一个sz，rz命令，可以实现文件的相互传输；
四，当然，你也可以使用ftp服务器，windows或者linux都可以做客户端或者服务器，设置你自己在搜集一下；
五：tomcat是不分平台的，也就是说下载的自解压文件包在linux和windows下都可以使用，当然，不包括windows安装包；
多多学习吧。希望你能坚持下去。

这个，这个，我很有兴趣研究讨论一下，ssh应该要用到openssl的开发包，但是你又要单用tomcat做www服务器，tomcat怎么连接ssl还真没研究过……，apache倒是会的，tomcat连接apache也大概知道，mysql不是大问题，这个数据库的结构比较简单了，另外也有很多工具可用，比如说phpmyadmin，我主要研究linux服务器，我们可以讨论下啊:)