为什么近几年GDP每年两位数增长，税收跟公务员工资也增长，只有纳税人的工资不涨

这个问题很有深度，是个分配结构的问题。你说的纳税人也可以再细分为两类，一类是以劳动性收入为主（工人），一类是以资本性收入为主（企业家或者说资本家）。工人也可以再分为两类，一类是国有企业的工人，一类是其他工人。
税收国家调节分配的手段，主要征收对象是企业和个人，估计目前的税赋是偏重的（起码对于普通人而不是富人来说）。国家领导、干部都是公务员，自然不会给自己分的少了。
企业与企业之间，国企占有的资源多，相对强势，因此在企业与企业之间的竞争中，国企拿走的多。国企的利润率不高，因为他分配给职工的也很多。而民企或其他企业拿的就少，分配给职工的肯定不会多。企业家的收入既包括劳动收入也包括资本收入，因此拿的也不少。如下：
国家（拿的多）
国企（拿得多） 其他企业（企业家）（拿的较多）
国企职工（拿得多） 其他职工（你？我？）

注意，中国的GDP增长了，并不代表我们的收入就跟着那么快的涨，还有，最近的金融危机，很多企业都是负载过日子的，如果都加工资了，那么它就不用活了！金融危机过后会涨的！
有一句名言说的好：每个人都要好，那么谁来衬托啊；人人都要做花，谁来做草啊！现实是残酷的，企业老板都是为了最大的利益，而且是私营企业···好好理解理解吧！

大部分都涨了吧，不过总有些人收入下降的。

因为我们不归财政拨款，所以企业好工资就高，不好工资就低。