政府机构控制其他国家机构吗

国家机构大于政府机构。国家机构包括全国人民代表大会，国家主席，国务院，中央军委，地方各级人民代表大会和地方各级人民政府，民族自治地方的自治机关，人民法院和人民检察院。而政府机构包括国务院及国务院组成部门(各部委办局)，国务院直属特设机构，国务院直属机构，国务院办事机构，国务院直属事业单位，国务院部委管理的国家局等等。

控制

法律上是不控制的
政府行驶行政权利，法院，检察院，公安机关行使司法权，军队行使特殊的权力，人代会行使立法权。
然而，目前有些地方，政府一揽大权，除了军队外，其他的机构他们都觉得自己有权管理。
法定和现实还是不同的

政府机构不能控制公检法人大政协和军队

当然可以，上级可以控制下级的。中央控制地方。总理跺跺脚省长尿裤裆。