柯南，基德，灰原，服部，琴酒，毛利小五郎，阿篱博士的实力谁最强。

琴酒（他能混到组织里的老大，可见实力非凡）
柯南（对于组织里琴酒来说，柯南毕竟是外行）
灰原（也是组织里训练出来的，但在某些方面还是比柯南差一点）
基德（他和灰原基本上没什么交集，排在灰原后面纯属个人意见）
服部（虽然头脑是很好啦，但在他们之间就略显单纯）
毛利小五郎（不想说什么了，废物一个！不过身手比阿立强~）
阿立（其实他和毛利是半斤八两啦~但因为有段时间网上不是传阿立就是幕后的老大吗？我对他的印象就刷的一下下来了！）

ok了？这可是原创~！

琴酒
柯南
基德
服部
灰原
阿篱博士
毛利小五郎
(个人意见,仅供参考)

如果阿笠博士是最终BOSS的话，绝对是他。
如果不是的话，应该是琴酒，谁都做不到他
但是呢，照理来说应该是柯南的，谁让他是主角

你是指武力还是智力

智力来说
柯南 琴酒 服部（前三个不分先后）基德 灰原 阿篱博士 毛利小五郎 （小五郎属于大指诺愚）

怪盗基德>琴酒>柯南>服部平次>毛利小五郎>灰原>阿笠博士
还有赤井秀一啊，还有苦艾酒，茱蒂，波本（未出场），冲矢昴（可以和柯南同速破案）

柯南 服部 基德 琴酒 灰原 阿篱博士 毛利小五郎

我觉得一次顺序为上面的排列

也不太好说，各有各长处嘛