blast 的结果怎么选啊

那要看你是什么目的了。从同源性比较你可以看出你的序列和哪些其他序列具有较高相似性，那么可以从别的序列所编码的蛋白质的功能来推断你的序列的功能。还有可以找相关的结构域。

不知道你blast什么东西？
比如blast一段未知细菌的16sDNA的序列，然后就可以得到和它同源性由高到低排列的已知菌的16sDNA序列，那么你大概就可以知道未知细菌是什么了。