在派出所里留下指纹会有底案吗?

指纹与案底是两个问题。案底一般指违法犯罪的记录。留下指纹只是获取证据的一种途径，如果留下指纹证明案件不是你所为自然就没有你的案底。

有违法行为并被依法处罚，才会留下所谓的“案底”。有没有案底，自己心里是最清楚的。跟有没有留下指纹资料并无关系。