报考中科院研究生的外语系,是不是本科必须是外语,其他专业可以吗

不需要的，
这个建议你参考一下中科院的招生简章吧，招生简章上明确写着报考的条件，还有招生专业目录、招生人数、参考书目等相关信息，别人间接告诉你的东西都和招生简章有出入，所以最权威的还是参考招生简章。
《全国各招生单位2009年硕士研究生招生简章》，你在百度上搜索一下就可以。