有什么办法隐藏文件夹，让WINDOWS无法搜索到里面的文件，把硬盘挂到别的电脑也无法搜索到

用加密软件

右键属性，选择隐藏。
或者就给账户设置密码，然后，把不想给别人看的分区加个权限。

你想自己写个文件系统吗？
windows下使用的大部分是fat或者ntfs的文件系统……

楼上...呵呵。暂时不清楚，或许有的软件可以。虚拟分区？你干脆再把分区加密吧...想访问都要密码。。。敢情您是国防部的？哇哈哈~