在故障车辆后方放置木墩，水桶等物品算不算警示标志

不算。但在你没有的情况下，只能智慧了，交警要是发你你也无言（因为验车时会检查警示牌、和灭火器的）。因为正规的警示标志有醒目、反光的作用。但你说的木墩，我个人觉得不行，木墩和路面颜色接近，如果后车没有及时发现判断失误撞上可能引起他人交通事故【若是想临时起到警示后车的作用我想要比用警示牌的距离更大一些，这样才能给候车足够的反应时间】

严格意义上不算，但如果你在没有正规警示标志下可使用，不过应该有其他辅助标志。