我是北京一个大二的本科生，专业是软件工程，高手指导下，在哪方面应当着重学习

抓好一门语言，尽量学的深一些。其他的，根据老师上课内容，尽量都弄明白。
还有数学可以好好学一学。

有时间考些证吧。没坏处。不管是为了就业还是将来升学。
还有，关于就业还是考研这个问题。看你自己。实际上我觉得，如果本科可以找到好工作，读太多书没有意义。尤其是像你这种应用学科的。

但是如果你想有长远发展的话，建议你还是向管理技能偏一下。
考研要早作打算。现在开始复习可能会有点早。但是早动手准备就会充分一些。到时候工作和考研都可以两不耽误。