运输发票过期问题

公路运输发票是自开票日起90日内认证抵扣，过期就不能认证了。你可以把发票退回去作废再请他们重新开就行了。

根据国家税务总局关于货物运输业若干税收问题的通知国税发〔2004〕88号文件规定：
十、关于货运发票的抵扣问题
（三）、增值税一般纳税人取得的货物运输业发票，可以在自发票开具日90天后的第一个纳税申报期结束以前申报抵扣。

因此，按照您的表述，贵公司是1月份开具的发票，可以在自发票开具日90天后的第一个纳税申报期结束以前申报抵扣，应当是5月份的这个纳税申报期申报抵扣是有效的，不存在过期。

文件链接：
http://202.108.90.146/guoshui/action/GetArticleView1.do?id=1848&flag=1

运输发票过期后不能重新作废，也不能再进行抵扣，只能双方协商解决了。如果税额较小的话，应该可以协商的通的；如果税额较大，就要看谁承担损失了，应该是谁的责任谁承担，你想再找他们开，如果他们不存在账外的话，他们不可能再开票了，不过你没有别的选择，只能试试看了。

没有办法了
只能重新开具

重新纳税