普通本科毕业证书和自学考试本科毕业证书什么区别啊？含金量有多大差异啊？

差很多，现在很多单位都看第一学历，就是指普通本科毕业证书，自学的各科本科毕业证书，只能用于进职称等辅助参考。
在国企，普通本科毕业，用人单位当做干部使用，而自学的所有证书，对招工形式没有帮助，上班了，也是工人，只有正式聘用后，才是干部。