转户口和毕业证书有联系吗？

没有关系，你在南通工作，可以录用、聘用为理由向南通市公安机关申请将户口由南京市迁移至南通，南通方面审核同意后，会发给你准予迁入证明（有二联：迁出地联和迁入地联），你持迁出地联到你现在南京户口所在地的派出所办理户口迁移证，然后持户口迁移证和准予迁入证明的迁入地联到迁入地的派出所落户即可。

转户口跟毕业证书一般没有关系，两者没有必然的联系。简单的说户口在两地互转关键是一方愿意接收就行，只要你南通方面你有可落户的地点，南通方面肯接收就不存在问题啦。

和当地的政策有关，就是说当地派出所如果要毕业证，你就要出示。

没关系，只要南通能出示接收函就能迁