便携式文件夹加密器能给刻录光盘加密吗？

不能
因为加密后由于文件路径的原因
刻录时会导致无法找到路径的
如果是可再写刻录盘的话，就可以把文件连同加密软件一起刻录上去再加密

这个请你去软件作者那里咨询，不要乱试，否则可能白忙火，是否有光盘加密的功能，软件使用说明里应该有明确说明的，正规的软件都会有。或建议选用专门针对光盘加密的软件，如： crypt cd

可以，但是必须在加密以后再刻录到光盘！再把加密器附带刻上，要不你换机子后没解密密钥！