如何使用NIBC比较一个物种某基因与其他物种的同源性

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/05/29 11:25:01
已有一克隆的基因片段,如鸭的MEF2D基因,请问如果使用Genbank找到在上面发表的该基因,并进行相似性比较?希望能说详细点,我是生手,为了写论文才第一次使用NCBI,英文又不好,谢谢。
比如我要在上面查找已发表的鸭的MEF2D基因,并与我克隆的鸭的MEF2D基因比较,怎么做?

怎么找楼上说了,我说补充问题。

你有两种发法,1是直接在blast的结果下面就能看到,比如Evalue
只是粗略比较的话,用这个就可以看到,哪个物种的和鸭MEF2D基因最相似,第二相似。。。。。。
第二个比较麻烦,要论文的话,一般要做出系统发育树,blast自带的那个树只是定性的,要把你觉得有必要比较的下载到本地,用clastalw或者mega等软件进行比对。
这种东西,网上问是没希望回答清楚的,尤其是怎么使用那几个软件,你找你们学校会的同学吧

在blast里面,用你已有的鸭的MEF2D基因导入,在blast一下就ok了

进blast,里面有个框的,把基因片段粘进去,再点击blast,就出来很多同源的了