去医院检查后，小便疼痛是怎么回事？

各位医界人士帮我看看是怎么回事？
我是男士、25。
我5.15日去医院做检查（想要小孩前做准备），查了支原体和衣原体，就是在提取样本后，（用棉棒提取的）小便时尿道口有强烈的刺痛感，我以为是刚检查过才会这样，但是都过了半天了，还是有此感觉。
心里有点紧张，不会是去医院检查的时候，感染了什么病吧？
在去医院检查之前，一切正常。
请各位帮帮忙，我该怎么办。
谢谢！！！
是不是医院造成的？

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