染色体蛋白质与DNA复制的调控

如果你指的"染色体中的蛋白质"是histone这类的话，我可以回答你：

染色体平时有histone（染色体蛋白质）保护着，这样那些复制酶就接触不到DNA，也就没有复制。

在特定的情况下（这个就是所谓的调控）histone会走开、分散、变构、等。这样复制酶就有空当可以去碰到DNA，就开始复制了。

《生物化学第二版》有详细的说明，建议找纸质的
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首先，DNA是染色体的组成部分之一，另外一部分则是蛋白质，蛋白质包裹着DNA便形成了染色体。当细胞进行有丝分裂的时候，原本呈双螺旋体结构的DNA会开始解旋，根据碱基配对（A与T配对，C与G配对）和反向平行（3'端和5'端)的原则进行复制,最终形成两条新的DNA,分别经入两个子细胞中.
你说得比较含糊,所以也不知道该说些什么给你听,希望上述内容对你有帮助.

中心法则搞明白了就什么都懂了。
建议你找高三生物书看一下。
比什么都详细，也不难。