引物能容忍几个错配，即有几个mismatch还能工作？

5'端几个碱基的错配是没关系的，但3'端的3个碱基一定要完全配对才行。否则引发率会相当低。

5'端几个碱基的错配是没关系的，但3'端的3个碱基一定要完全配对才行。否则引发率会相当低。
回答者： fengfeixue0219 - 一代宗师 十四级

恩 是的 但并不是说只要3'端的3个碱基完全配对就一定行 因物一盘是17-22bp的长度

中间有2-3个错配可以忍受，但最好不是连续的错配，此外，3'端的3个碱基一定要完全配对才行

最好没有错配，一般错配一个，退火温度降无度。如果错配在尾端的话，一般没有影响；如果错配在中间，影响程度会加大。另外与酶等问题有关。此类问题答案都不是很严谨。