注册安全工程师和建造师分别注册两公司可否

这个是可以的，因为安全工程师和建造师不是一个系统发的证件。

安全工程师是国家安监局发的证，而建造师是建设部发的证。所以理论上是可以的，但是像一级建造师和二级建造师和造价师等等都是必须只能挂到一个公司的。

可以