大学时候曾写过2次入党申请书，毕业后的档案袋里会同时有这两份申请书吗？

如果你没上过党课，没有党课结业证。档案袋里就没有你的申请书。转了党组织之后，你需要重新申请。然后上党课。
如果你上过党课，有了党课结业证。可以在转了组织之后，由别人推荐入党。
档案袋里只会有一份一般是最近的一份。

一般没有啊！！除非你已经被发展了，那样会有专门的党员关系档案，如果没有的话是不会有的，党员关系与毕业生档案是不放在一起的！

不会，必须有党课的结业证书才有可能算你是入党积极分子，要不然那些申请书是不算数的，不会入档案，现在说不好已经在你们学院党委办的某个旮旯等待灰尘呢！

如果你没有入党，就不会入档案的，我入党的时候书记说，我们写的申请书已经放的很脏了，结果我们又重新写了一份放档案里了。即使你被确定为入党积极分子也不会写入档案的，加油吧，党组织欢迎你