护照在内地办的，但签证的时候能在乌鲁木齐签证吗？

要看是不是在新疆有大使馆，如果有就可以办。如果没有，要到有哈萨克斯坦大使馆的城市去办。
另外如果哈萨克斯坦是落地签证的话，直接买机票到了哈萨克斯坦的机场办就可以的。

护照和签证本来就是两回事，护照有了就不用再办，签证就要看是什么国家，有些是入境签证、有些是落地签证，还有些是要先在中国的大使馆就想要办好的，你的哈萨克斯坦可能想要去中国的领事馆办好

哈国在乌鲁木齐有个签证代办处
去那办签证就行了