我没有非法关机但是为什么开机时出现非法关机的保护程序

你说的应该是开机自检吧。

那估计是你每次开机的话，那个自检过程你都没有走完，
还是不行的话，你就取消开机自检

1.开机按delete键进入BIOS，进入高级配置页面（Advanced Setup Page）,找到Quick Boot项，设置为 Enabled.就会跳过自检

2.2000/xp的是用chkntfs /x后面加盘符,比如禁用d盘
chkntfs /x d:

如果是windows98:
98的可以用系统自带的msconfig工具

在“运行”的输入框中，键入“msconfig”，按“确定”按钮。这时会启动系统配置实用程序，在常规选项卡里点击“ 高级”按钮，然后选中“如果关机失败，请禁用磁盘扫描程序”前面的选择框，就可以了。